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Research from the Nasuda and Shimizu Groups Featured in the Nikkei Newspaper

NASUDA Shuhei

Jun. 6, 2025

A joint research study led by the Nasuda Group (Kyoto University) and the Shimizu Group (University of Zurich) was featured in the June 3, 2025 edition of The Nikkei.

The article highlights their latest publication:

Title: Unveiling yellow rust resistance in the near-Himalayan region: Insights from a nested association mapping study
Authors: Katharina Jung, Reiko Akiyama, Jilu Nie, Miyuki Nitta, Naoto-Benjamin Hamaya, Naeela Qureshi, Sridhar Bhavani, Thomas Wicker, Beat Keller, Masahiro Kishii, Shuhei Nasuda, Kentaro K. Shimizu
Journal: Theoretical and Applied Genetics
https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-025-04886-z

You can read the full article in The Nikkei here:

Author

NASUDA Shuhei

  • Professor
  • Nasuda Group
  • Kyoto University
  • Environmental Responses
  • Genome Flexibility
  • Reproductive Development
  • Imaging
  • Field science

ETH–UZH–UTokyo Joint Symposium Co-hosted by KEPLR

TSUCHIKANE Yuki

May. 12, 2025

We are delighted to co-host the ETH–UZH–UTokyo Joint Symposium in partnership with KEPLR (Key-Molecule-Network in Plant Reproduction). Organized by the Division of Plant Biology and Chemical Biology at the University of Tokyo and KEPLR, this one-day event will bring together leading researchers from ETH Zurich, the University of Zurich, and our department to showcase cutting-edge advances in plant science, chemical biology, and bioengineering.

KEPLR members Prof. Dr. Jeffrey W. Bode (PI), Prof. Dr. Kentaro K. Shimizu (PI) and Dr. Yuuma Ishikawa (formerly of the Wolf lab) will also present at the symposium.

Date & Venue
May 14, 2025 (Wednesday)
5th-floor Auditorium, Chemistry Main Building
Department of Chemistry, School of Science, The University of Tokyo

Featured Presentations:

Long-distance translocation of sugar/gibberellin detected by new ultra-high sensitive sugar/gibberellin genetically encoded biosensor
Yuuma Ishikawa¹²³, Tetsuya Higashiyama³, Wolf B. Frommer¹²
¹ Heinrich Heine University Düsseldorf, Institute for Molecular Physiology, Germany
² CEPLAS, Düsseldorf, Germany
³ University of Tokyo, Department of Biological Sciences, Japan
Responses to environmental stress in polyploid plants
Ryohei Fujita¹², Rie Shimizu-Inatsugi¹, Muneo Sato³, Tetsuya Mori³, Masami Yokota Hirai³, Kentaro K. Shimizu¹²
¹ University of Zurich, Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, Switzerland
² Kihara Institute for Biological Research, Yokohama City University, Japan
³ RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Japan

Responses to environmental stress in polyploid plants
Ryohei Fujita¹², Rie Shimizu-Inatsugi¹, Muneo Sato³, Tetsuya Mori³, Masami Yokota Hirai³, Kentaro K. Shimizu¹²
¹ University of Zurich, Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, Switzerland
² Kihara Institute for Biological Research, Yokohama City University, Japan
³ RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Japan

Searching for Pollen Number Controlling Genes
Taro Takahashi¹, Hiroyuki Kakui², Takashi Tsuchimatsu³, Kazuki Fukushima¹, Afif Hedhly⁴, Ana Marcela Florez-Rueda⁴, Ueli Grossniklaus⁴, Naoto-Benjamin Hamaya¹, Michaela Oborská-Oplová⁵, Vikram G. Panse⁵⁶, Kentaro K. Shimizu¹
¹ University of Zurich, Department of Evolutionary Biology and Environmental Studies, Switzerland
² University of Tokyo, Institute for Sustainable Agro-ecosystem Services, Japan
³ University of Tokyo, Department of Biological Sciences, Japan
⁴ University of Zurich, Department of Plant and Microbial Biology & Zurich-Basel Plant Science Center, Switzerland
⁵ University of Zurich, Institute of Medical Microbiology, Switzerland
⁶ University of Zurich, Faculty of Science, Switzerland

Author

TSUCHIKANE Yuki

  • Project Assistant Professor
  • Tsuchimatsu Group
  • The University of Tokyo
  • Genome Flexibility
  • Field science

渡航報告:Shimizu Group, University of Zurich

Shunsuke Yoshioka

Feb. 15, 2025

京都大学農学研究科の吉岡俊輔です。 2023年11月から2024年11月までの1年間、チューリッヒ大学の清水健太郎先生の研究室に滞在していました。今回はその体験談を記したいと思います。

渡航前・到着直後

受け入れ先に関しては、受け入れ先のPI が共同研究者でもあった清水先生だったので非常にスムーズに話が決まりました。スイスに1年以内の滞在をする場合は、居住許可証が必要ですが、チューリッヒ大のオンラインフォームから必要書類をアップロードして承認されると、チューリッヒ大の事務の方々が後の発行手続きをすべて行ってくれました。もう少し面倒な手続きがいるのかと思っていたのですが、本当にスムーズに必要な書類の準備をしていただき驚きました。現地に到着すると、まず移民局で登録、住居のある市の役所で住民票の登録、現地での保険への加入、スマホの通信の契約などの手続きをすませました。これらについても特に大きなトラブルなく済ませることができました。

現地での生活

スイスではシェアハウスが主流でした。個人の部屋が一室あって、バス・トイレ、キッチンを共有するというタイプです。僕の場合は、大家さんである60代後半の素敵なご夫妻ソーニャ、マーカスさんのご自宅の一室をお借りして、キッチン・バスはシェアという形でした。スイスは特に部屋探しが大変で、部屋を決めるのに何回も内見にいって、数ヶ月もかかるというのが一般的です。僕の場合は、幸運なことにソーニャとのオンライン面接だけで採用されました。ソーニャ曰く、息子さんであるオリバーが「日本人は間違いなくいいやつだから」(??)と言ってくれたのが決め手だったようです。そのため渡航前に部屋を決めることができました。ただ、チューリッヒ大学に長期滞在される方は、まずホテルか清水先生のお知り合いの家に一時滞在してから部屋を探すことになる場合もあるかと思います。

日々の食事は、スーパーで買って自炊をしていました。レストランの食事は5000-6000円以上はかかるので、あまり頻繁に外食はできません。また、日本のように一人でふらっと入れるコンビニや安いチェーン店がないので、自分で作るしかない状況でした。スーパーの食品は比較的安いです(人件費が高いので加工の工程で人の手が入るほど値段が跳ね上がるイメージです)。僕は安いトマト缶やツナ缶を買い込んでパスタをつくったりしていました。お昼は前の日に作った余りものをもっていったり、学食で食べたりしていました。ちなみにチューリッヒ大学の学食は、(スイスにしては)リーズナブルな値段(1食1300円程度)で食べられます。 たまに、ソーニャマーカス夫妻が一緒に晩ごはんを食べようと招待してくれました。週一で息子のオリバーも帰ってきて、いろいろな種類の料理を食べることができました。

チューリッヒも中心部をすこし外れるとのどかな牧場や畑、チューリッヒ湖など自然豊かな場所が多く、ランニングや散歩をするのにぴったりの場所でした。ちなみに、現地では頻繁にマラソン大会が開催されており、僕もラボのメンバーと一緒にチューリッヒマラソンとまた別のマラソンに合計2回参加しました(どちらも10km部門ですが)。ラボのとある人は、二人一組で深夜にスタートし、自転車とランニングで、80kmを翌朝までかけて走り切るというハードなコンペティションにも参加していました。

チューリッヒはトラム(路面電車)が非常に便利で、市内のどこにでも1回の乗り換えで大抵のところは行けます。通学や市内のどこかに出かける際も自動車・自転車などはほぼ必要なく、すべてトラムで完結できます。僕もトラムを使って通学していました。人口が少ないので通学の電車が満員ということはなかったです。

費用については、僕の滞在していた期間はかなり円安の時期でした。円安があまりに進行したタイミングで那須田先生がそれに応じて月の支給額を調整してくださいました。生活費に関しては、経済状況も鑑みて、PIの方々とよく相談して柔軟に対応していただければと思います。
今回の滞在では、KEPLRに関わる多くの方々のご協力とご支援のおかげで、1年間という長期間の滞在が実現しました。本当にありがとうございました。

Author

Shunsuke Yoshioka

  • Nasuda Group
  • Kyoto University

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International Marchantia Workshop 2024 Report

TSUCHIKANE Yuki

Jan. 15, 2025

The International Marchantia Workshop 2024 was held from November 18th to 21st, 2024, at the RCCBC Conference Center in Hiroshima, Japan. This workshop was co-organized by Professor Takayuki Kohchi (Kyoto University), the Principal Investigator (PI) of the KEPLR project.

The workshop had a total of 192 participants, with:
• 105 attending in person (69 domestic and 36 international participants)
• 87 attending online (49 domestic and 38 international participants)

The KEPLR project invited 8 international participants, including Professor Ueli Grossniklaus, as well as postdoctoral fellows and graduate students from the Grossniklaus, Weijers, Feng, and Berger groups.

Among the speakers were:
• Ueli Grossniklaus (KEPLR Vice-Director, University of Zurich)
• Minako Ueda (KEPLR PI, Tohoku University)
• Tetsuya Hisanaga (KEPLR Junior PI, Nara Institute of Science and Technology)

This workshop highlighted KEPLR’s strong international collaboration and contributions to advancing Marchantia research.

Author

TSUCHIKANE Yuki

  • Project Assistant Professor
  • Tsuchimatsu Group
  • The University of Tokyo
  • Genome Flexibility
  • Field science

[Co-Hosted by Our Project] Cold Spring Harbor Asia, Awaji, International Symposium (May 18–22, 2025)

TSUCHIKANE Yuki

Dec. 5, 2024


The abstract deadline has been extended to March 28.
(2025.3.10)

We are pleased to announce that the Cold Spring Harbor Asia, Awaji, International Symposium will be held from Sunday, May 18, to Thursday, May 22, 2025. This symposium is co-hosted by Prof. Takeshi Izawa (The University of Tokyo), representing the topic “Genomic dynamics underlying the plastic hermaphroditism in plants (https://www.ige.tohoku.ac.jp/prg/flower/)”, and KEPLR.

We warmly invite everyone to participate!


Dates:
Sunday, May 18 – Thursday, May 22, 2025

Venue:
Awaji Yumebutai International Conference Center
1 Yumebutai, Awaji City, Hyogo Prefecture, 656-2301, Japan

Schedule
Date: May 18 (Sun)
Morning: -
Afternoon: Arrival & Registration
Evening: Reception Party

Date: May 19 (Mon)
Morning: Session 1
Afternoon: Poster Session
Evening: Session 2

Date: May 20 (Tue)
Morning: Session 3
Afternoon: Lunch Excursion, Poster Session
Evening: Session 4

Date: May 21 (Wed)
Morning: Session 5
Afternoon: Poster Session, Session 6
Evening: Banquet

Date: May 22 (Thu)
Morning: Free Discussion & Departure
Afternoon: -
Evening: -


For more details, visit:
Plant Reproductive Development and Genomics, Awaji, Japan (https://www.csh-asia.org/?content/2653)